През 1996 г., този вид обучение се преструктурира в Библейски колеж "СИОН" с четиригодишен курс на обучение, завършващ с бакалавърска степен по Теология.

Първият випуск на БК "СИОН" завършват 15 души, членове на ХЦ "СИОН" и активни служители, които се включват в изграждането на нови църкви и структурирането на служенията в църквата.

След 2000 г. Библейския колеж насочва своите усилия в подготовка и изграждане на лидерите на новосъздадените църкви от региона на гр. Стара Загора, които преминават двегодишен курс на интензивно обучение. Систематичното обучение мотивира много хора да разгърнат дарбите и способностите си за постигане на по-ефективно служение в локалните църкви.